Genetyczne powiązania z ciążowym czasem trwania i spontaniczne porody przedwczesne ad 5

Allele, które były związane z dłuższym okresem ciąży, były również związane ze zwiększonym ryzykiem raka prostaty (rs10934853-A), 25 zmniejszone ryzyko spodziectwa (rs2999052-C), 26 i późniejszy wiek menarche (rs2687729- G) .27,28 W locus WNT4, pięć znaczących SNP w ścisłym braku sprzężenia, które były związane z czasem trwania ciąży, okazało się być związane z endometriozą, 29 rakiem jajnika, 30 i gęstością mineralną kości. [31] Allele WNT4, które obserwowane jako związane ze zwiększonym czasem trwania ciąży zostały wcześniej zidentyfikowane jako allele ryzyka dla endometriozy, raka jajnika i niskiej gęstości mineralnej kości (Tabela S10 w Dodatku Uzupełniającym). Zgodnie z bazą danych GTEx niektóre SNP w czterech replikowanych loci (EBF1, EEFSEC, WNT4 i ADCY5) mogą wpływać na poziom ekspresji informacyjnego RNA pobliskich genów20 (Tabele S11 i S12 w Dodatkowym dodatku). SNP w locus ADCY5 powiązano z masą urodzeniową32 i cechami glukozy we krwi.33 Niedawno metaanaliza ujawniła SNP w loci ADCY5, WNT4 i EBF1, które są związane z wagą urodzeniową.34 SNP, które były zamieszane w ta metaanaliza, w loci ADCY5 i WNT4, wydaje się wpływać na masę urodzeniową poprzez genom płodu. Żaden z tych SNP nie wykazywał ścisłego sprzężenia z SNP wykazującymi znaczący związek z czasem trwania ciąży, podczas gdy SNP w locus EBF1 (rs7729301) wydaje się wpływać na masę urodzeniową poprzez efekt matczyny, a allel (G), który był masa urodzeniowa wiązała się z krótszym czasem trwania ciąży (tabele S8 i S10 w dodatkowym dodatku).
Wpływ genetyki matczynej lub płodowej.
Następnie przebadaliśmy pod kątem związków między implikowanymi SNP a czasem trwania ciąży i porodem przedwczesnym w próbkach niemowląt (tabele S13 i S14 w dodatkowym dodatku). Obserwowaliśmy takie same asocjacje, jak w próbkach matczynych, w tym samym kierunku, ale o mniejszych rozmiarach efektu (Tabela S15 w Dodatku Uzupełniającym). Wielkości efektów, które zostały oszacowane na próbkach dla niemowląt były silnie skorelowane z wielkościami efektu, które zostały oszacowane z próbek matek (r2 = 0,95) i były w przybliżeniu o połowę mniejsze niż te efekty, co potwierdza teorię, że efekt obserwowany u niemowląt spowodowane jest dzieleniem się jednego allelu macierzyńskiego przez pochodzenie (ryc. S4 w dodatku uzupełniającym). Ponadto analiza wspólnych powiązań w parach matka-niemowlę wykazała znaczące związki wyłącznie z genotypami matczynymi, ale nie z genotypami płodów, co również wskazuje na matczyne pochodzenie zaobserwowanych powiązań genetycznych (tabela S16 w dodatku uzupełniającym). Szacowane wariancje fenotypowe wyjaśnione przez wszystkie powszechne SNP u matek (częstość mniejszych alleli,> 0,01) wynosiły około 17% dla czasu trwania ciąży i 23% dla porodu przedwczesnego, jako przekształcone w odziedziczalność podstawowej odpowiedzialności za chorobę (tabela S18 w tabeli Dodatek dodatkowy). Ustalenia dotyczące wykrywania heterogeniczności alleli, efektów dominacji, procentu wyjaśnionej wariancji oraz wzbogacenia zestawu genów i analizy ścieżek podano w części opisującej inne analizy statystyczne i bioinformatyczne w dodatkowym dodatku.
Dowód funkcjonalny Implicating WNT4
Lokus WNT4 implikuje endometrium jako determinantę narodzin przedwczesnych.35 Funkcja WNT4 ma kluczowe znaczenie dla decydualizacji endometrium, a następnie implantacji i ustalenia ciąży.36 Przy użyciu sekwencjonowania RNA potwierdzono zasadnicze indukowanie ekspresji WNT4 z decydualizacją, ponieważ nie wykryliśmy transkryptów na milion przed decydualizacją in vitro i 29,5 transkryptów na milion po decydualizacji.
Rysunek 2
[więcej w: wyposażenie stajni, hologramy els, skręcenie stawu skokowego ]

Powiązane tematy z artykułem: hologramy els skręcenie stawu skokowego wyposażenie stajni